Sąvartyno dugne bus įrengtas nepralaidus sluoksnis, atitinkantis ES reikalavimus bei Lietuvos Respublikos normatyvus. Kadangi natūralus gruntas, kaip ir praktiškai visoje Lietuvos teritorijoje netenkina minėtų reikalavimų, bus įrengiamas dirbtinis geologinis barjeras. Jo storis ne mažiau 0,5 metro. Jei molio užtikrinama apsauga bus nepakankama, papildomai bus klojamas 6 mm geosintetinio molio paklotas, kurio užtikrinama izoliacija žymiai geresnė nei natūralaus molio. Bet kuriuo atveju, kad užtikrinti žemės gelmių apsauga, dar klojama 2 mm storio aukšto tankio polietileno (HDPE) geomembrana, kuri yra praktiškai nepralaidi skysčiui plėvelė. Siekiant apsaugoti nelaidžią plėvelę nuo mechaninių pažeidimų, ji bus uždengta specialios geotekstilės danga.

Visa ši sudėtinga dugno konstrukcija baigiama drenažo (filtrato) surinkimo sistema. Ją sudarys 0,5 m storio drenažo sluoksnis sudarytas iš žvyro bei drenažo vamzdžiai. Surinkta filtratą planuojama valyti Vievio nuotekų valymo įrenginiuose. Ateityje, keičiantis filtrato sudėčiai ir kiekiui numatyta galimybė atlikti dalinį filtrato valymą pačiame sąvartyne.

Taip pat sąvartyne bus įrengta dujų surinkimo sistema. Tuo tikslu bus įrengti vertikalūs dujų ištraukiamieji gręžiniai, kurie bus ilginami augant atliekų kaupo storiui. Sąvartyno eksploatacijos metu planuojama surinkti 70% dujų, uždengus sąvartyną - 90% dujų. Pradiniame etape, kai dujų kiekis bus nedidelis, jos bus sudeginamos, vėliau planuojama įrengti dujų generatorių ir gaminti elektros energiją.